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烦!分群不清的抗原如何分析?iMFI来帮忙

归档日期:08-06       文本归类:后方干扰分群      文章编辑:爱尚语录

  站友@steven 曾在网站上提了一个很多人做科研中都会碰到的事情,就是如下图这样,

  确实,在流式检测中,经常会碰到一些弱表达的信号,无论是临床还是科研,此时,Marker的放置就成了关键,否则一不小心,稍微拖动一下,百分比就大变。

  1、优先采用下面这种Contour Plot,不少分析软件中都可以找到。Contour Plot这种类型,比较容易使我们找到边界,设门容易有参考依据(如下图的右上方)。说到这里,切记,生物学阴性参照才是正确的阴性对照,要避免用同型、空白对照设门。

  如果觉得百分比不是很合适,可以用MFI,也可以考虑用更有意思的iMFI。

  iMFI全称是integrated MFI,等于MFI值×表达率,相当于反映了蛋白在细胞上的总表达量,Darrah等人在Nature Medicine (2007) 13:843-850[2]上的疫苗研发文章上提出了这个概念,认为iMFI更能够胞内因子分泌水平,更好地反映疫苗有效性。

  不过,无论是iMFI还是MFI来作为结果,需要注意的是,你的仪器质量控制都要做得非常好,以保证每次实验的仪器状态都近乎一致。

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